Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTX2P47972 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms