Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTRNP46939 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTRNP46939 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTRNP46939 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTRNP46939 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTRNP46939 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTRNP46939 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTRNP46939 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UTRNP46939 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UTRNP46939 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTRNP46939 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTRNP46939 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UTRNP46939 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTRNP46939 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms