Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL21P46778 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL21P46778 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms