Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMPOP42166 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMPOP42166 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMPOP42166 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMPOP42166 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMPOP42166 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPOP42166 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPOP42166 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPOP42166 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMPOP42166 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMPOP42166 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMPOP42166 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPOP42166 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPOP42166 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMPOP42166 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMPOP42166 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMPOP42166 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMPOP42166 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms