Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 SEC2YNL272C 2280 nt3.46□□□□□ -1.86
AVT7P40501 IOC2YLR095C 2439 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YML020WYML020W 1995 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 NAM2YLR382C 2685 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YGL108CYGL108C 423 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 ARD1YHR013C 717 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 IES3YLR052W 753 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SUI3YPL237W 858 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SLX1YBR228W 915 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SSL1YLR005W 1386 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YTM1YOR272W 1383 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YHL012WYHL012W 1482 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 NAM9YNL137C 1461 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SWP82YFL049W 1872 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SPO1YNL012W 1896 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 MTC4YBR255W 2085 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT7P40501 ABP140YOR239W 1887 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 CHD1YER164W 4407 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YCR085WYCR085W 354 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 REC104YHR157W 549 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 MMM1YLL006W 1281 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 RSF1YMR030W 1131 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 UBP10YNL186W 2379 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YRB30YGL164C 1323 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YOL075CYOL075C 3885 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT7P40501 USA1YML029W 2517 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 AIM21YIR003W 2040 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 HSP30YCR021C 999 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YDR230WYDR230W 348 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 RTA1YGR213C 954 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YPR174CYPR174C 666 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 FYV5YCL058C 459 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 VPS45YGL095C 1734 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 LOS1YKL205W 3303 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 ATG26YLR189C 3597 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 RTK1YDL025C 1863 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 FMP25YLR077W 1752 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 GAC1YOR178C 2382 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT7P40501 NUP133YKR082W 3474 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 HMG1YML075C 3165 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YBR225WYBR225W 2703 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 RCR2YDR003W 633 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YHB1YGR234W 1200 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 ECM34YHL043W 513 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 IDP2YLR174W 1239 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YBL036CYBL036C 774 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 ERD2YBL040C 660 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 IBD2YNL164C 1056 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YPL162CYPL162C 822 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SWH1YAR042W 3567 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 TYR1YBR166C 1359 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 UBP6YFR010W 1500 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SLX8YER116C 825 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 GVP36YIL041W 981 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 SPC3YLR066W 555 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 MSN4YKL062W 1893 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT7P40501 PPZ1YML016C 2079 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT7P40501 RDH54YBR073W 2877 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT7P40501 MSW1YDR268W 1140 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 FUR1YHR128W 651 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 RPB3YIL021W 957 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 TTI2YJR136C 1266 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 OAR1YKL055C 837 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YLR156WYLR156W 345 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YLR159WYLR159W 345 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YLR161WYLR161W 345 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 FLD1YLR404W 858 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 MCM1YMR043W 861 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YBL081WYBL081W 1107 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 APP1YNL094W 1764 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 AVT7YIL088C 1473 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YPR003CYPR003C 2265 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT7P40501 RAD26YJR035W 3258 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 IES6YEL044W 501 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 MAG1YER142C 891 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 RPS0AYGR214W 759 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 IGO2YHR132W-A 396 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 PIR3YKL163W 978 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 SRP40YKR092C 1221 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 YLR225CYLR225C 1224 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 CPR3YML078W 549 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 TAF4YMR005W 1167 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 VPS28YPL065W 729 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 RSC3YDR303C 2658 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 HCM1YCR065W 1695 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 SPT6YGR116W 4356 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT7P40501 MDM38YOL027C 1722 nt3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms