Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.353e-17■■■■■ 34.8
GTF2F1P35269 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-206ENST00000538646 1649 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-205ENST00000538626 582 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-213ENST00000544574 725 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-214ENST00000560968 3030 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HNF1A-204ENST00000535955 434 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-15■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 49.53□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.076e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 218.75■□□□□ 0.596e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 34.7
GTF2F1P35269 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.819e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.569e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 213.87□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 512.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-204ENST00000476111 573 ntTSL 320.72■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 520.6■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 06e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 412.83□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 511.43□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 34.6
GTF2F1P35269 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.023e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 214.82□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 TBKBP1-202ENST00000537587 705 ntTSL 314.5□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 34.5
GTF2F1P35269 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PISD-216ENST00000486675 837 ntTSL 315.46■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.282e-63■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 510.09□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 520.61■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-224ENST00000561991 964 ntTSL 519.27■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 518■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-220ENST00000487932 6464 ntTSL 517.49■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 516.06■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 516.06■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 515.97■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -02e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 514.73□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-216ENST00000483731 4193 ntTSL 514.44□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-202ENST00000414833 947 ntTSL 312.37□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-203ENST00000427274 1204 ntTSL 210.56□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-210ENST00000537788 582 ntTSL 37.42□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-208ENST00000491489 723 ntTSL 26.73□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 GOSR1-206ENST00000467635 584 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 CPNE7-209ENST00000568977 682 ntTSL 520.85■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.857e-8■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.817e-9■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-213ENST00000575667 1644 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-206ENST00000571418 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.1■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-211ENST00000572819 1345 ntTSL 523.83■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-215ENST00000576129 991 ntTSL 221.08■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DPH1-204ENST00000570833 558 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 522.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 11e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 34.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 73.2 ms