Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ALO1	YML086C	1581 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SIR1	YKR101W	1965 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	FMP10	YER182W	735 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	JLP1	YLL057C	1239 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	UPS2	YLR168C	693 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	HMX1	YLR205C	954 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YLR402W	YLR402W	192 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YBL036C	YBL036C	774 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	TIF34	YMR146C	1044 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SIW14	YNL032W	846 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	GLO3	YER122C	1482 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RRP1	YDR087C	837 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YHB1	YGR234W	1200 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SNL1	YIL016W	480 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	HIS6	YIL020C	786 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YGK3	YOL128C	1128 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	FYV5	YCL058C	459 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	TDA1	YMR291W	1761 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SSU1	YPL092W	1377 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	BUR6	YER159C	429 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	MRM2	YGL136C	963 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RNY1	YPL123C	1305 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	TPA1	YER049W	1935 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RPS14A	YCR031C	414 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SRN2	YLR119W	642 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YLR462W	YLR462W	609 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	TRM13	YOL125W	1431 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ACE2	YLR131C	2313 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	BSC1	YDL037C	987 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	MMS21	YEL019C	804 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YEL074W	YEL074W	339 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	PWR1	PWR1	941 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	CHD1	YER164W	4407 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	PHO87	YCR037C	2772 nt		3.09	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	GPB1	YOR371C	2694 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YDL071C	YDL071C	375 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	BNA1	YJR025C	534 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	DAN1	YJR150C	897 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	AIM26	YKL037W	357 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	PAM18	YLR008C	507 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NFI1	YOR156C	2181 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YGR273C	YGR273C	525 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	MBR1	YKL093W	1020 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	ATG8	YBL078C	354 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	GLO4	YOR040W	858 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	ALE1	YOR175C	1860 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NOP6	YDL213C	678 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	FBP26	YJL155C	1359 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YLR326W	YLR326W	723 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	MIH1	YMR036C	1665 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NAM9	YNL137C	1461 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	IST1	YNL265C	897 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	RKM3	YBR030W	1659 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NPL4	YBR170C	1743 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	CAP2	YIL034C	864 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	URA4	YLR420W	1095 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YMR114C	YMR114C	1107 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	IMP1	YMR150C	573 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YIM2	YMR151W	438 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	LTO1	YNL260C	597 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	PUF2	YPR042C	3228 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	MUP3	YHL036W	1641 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	ERG5	YMR015C	1617 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	HER2	YMR293C	1395 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	KIN3	YAR018C	1308 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VMA11	P32842	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.04	□□□□□ -1.92

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