Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H1P32780 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms