Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKLRP30613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKLRP30613 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKLRP30613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKLRP30613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKLRP30613 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKLRP30613 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKLRP30613 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKLRP30613 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms