Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLNP26678 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLNP26678 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLNP26678 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLNP26678 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PLNP26678 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLNP26678 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLNP26678 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms