Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTSSP25774 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTSSP25774 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTSSP25774 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSSP25774 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSSP25774 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSSP25774 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSSP25774 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSSP25774 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSSP25774 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSSP25774 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSSP25774 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSSP25774 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms