Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD2P25440 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD2P25440 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD2P25440 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD2P25440 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD2P25440 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD2P25440 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD2P25440 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD2P25440 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD2P25440 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD2P25440 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD2P25440 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD2P25440 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD2P25440 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms