Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4BP23588 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms