Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms