Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHCGRP22888 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms