Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms