Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2CP19387 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms