Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGR1P18146 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR1P18146 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR1P18146 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms