Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms