Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VEGFAP15692 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms