Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSPT1P15170 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSPT1P15170 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GSPT1P15170 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSPT1P15170 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms