Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB3P14651 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms