Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms