Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIP12755 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIP12755 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIP12755 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIP12755 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIP12755 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIP12755 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIP12755 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIP12755 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIP12755 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIP12755 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIP12755 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIP12755 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIP12755 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms