Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CKBP12277 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKBP12277 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CKBP12277 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKBP12277 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKBP12277 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKBP12277 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKBP12277 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKBP12277 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms