Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT7P08729 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT7P08729 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT7P08729 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT7P08729 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT7P08729 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT7P08729 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT7P08729 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT7P08729 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT7P08729 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms