Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPBP07199 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPBP07199 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPBP07199 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPBP07199 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPBP07199 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPBP07199 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPBP07199 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPBP07199 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPBP07199 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPBP07199 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms