Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB1P05556 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms