Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APODP05090 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APODP05090 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APODP05090 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APODP05090 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APODP05090 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APODP05090 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APODP05090 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APODP05090 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APODP05090 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APODP05090 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APODP05090 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APODP05090 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APODP05090 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APODP05090 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APODP05090 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms