Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P02748 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P02748 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9P02748 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C9P02748 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C9P02748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P02748 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P02748 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9P02748 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9P02748 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms