Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOEP02649 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOEP02649 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOEP02649 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOEP02649 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOEP02649 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOEP02649 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOEP02649 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOEP02649 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOEP02649 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOEP02649 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOEP02649 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOEP02649 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOEP02649 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms