Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL2A1P02458 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms