Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPOP01588 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPOP01588 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPOP01588 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPOP01588 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPOP01588 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPOP01588 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPOP01588 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPOP01588 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPOP01588 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPOP01588 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms