Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CPNE6O95741 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE6O95741 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms