Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNUPNO95149 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNUPNO95149 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms