Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A2O94788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms