Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms