Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH4O75427 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms