Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX3O75364 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX3O75364 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX3O75364 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX3O75364 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms