Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND1O60716 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNND1O60716 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms