Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
ABCC9O60706 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCC9O60706 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms