Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATCO43716 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATCO43716 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATCO43716 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATCO43716 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATCO43716 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATCO43716 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATCO43716 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATCO43716 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATCO43716 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms