Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF13O43567 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF13O43567 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF13O43567 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF13O43567 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF13O43567 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF13O43567 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF13O43567 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF13O43567 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF13O43567 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF13O43567 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF13O43567 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF13O43567 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF13O43567 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF13O43567 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms