Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms