Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA2O43464 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms