Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARPC5O15511 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms