Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNPHO15079 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNPHO15079 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNPHO15079 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNPHO15079 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNPHO15079 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNPHO15079 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNPHO15079 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNPHO15079 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNPHO15079 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNPHO15079 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNPHO15079 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms