Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP290O15078 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEP290O15078 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP290O15078 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP290O15078 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP290O15078 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP290O15078 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP290O15078 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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