Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PHOX2AO14813 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHOX2AO14813 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms