Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP2O00295 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP2O00295 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP2O00295 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP2O00295 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP2O00295 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TULP2O00295 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms